Projektleiter

Prof. Dr. Andre Franke

Institution

Universität Kiel Institut für Klinische Molekular Biologie

Contact

Vita

Ausbildung

2004 – 2006
Doktorarbeit an der CAU Kiel unter Prof. Stefan Schreiber und Prof. Thomas C. G. Bosch: “A systematic genome-wide association analysis for inflammatory bowel diseases”

2002 – 2003
Diplomarbeit unter Prof. Thomas C. G. Bosch an der CAU Kiel “Development of a high-throughput screening for identification of developmentally regulated genes in Hydra“

1998 – 2002
Studium der Biologie und Informatik (Diplom) an der CAU Kiel


Forschungserfahrung / Akademische Errungenschaften

2011
Gastforscher an dem Broad Institute des MIT und Harvard (Boston, USA) in der Forschungsgruppe von Mark J. Daly und betreut von Richard S. Blumberg
in der Stiftung “Peter Hans-Hofschneider” W2 Professur für die Stiftung für Experiemtelle Biomedizin (Zürich, Schweiz)

seit 2011
Direktor des Institut für klinische Molekularbiologie

2008 – 2013
Akademische Gastprofessur an der Medizinischen Fakultät, Universität Oslo, Norwegen (Rikshospitalet)

2008 – 2011
W1 Juniorprofessur für die Epithelial Barrier Diseases des DFG Exzellenzcluster “Inflammation at Interfaces”


wichtige wissenschaftliche Auszeichnungen / Funktionen

2012
Ludwig-Demling Forschungspreis der Deutschen Morbus Crohn und Colitis ulcerosa Vereinigung (DCCV); 25,000 €

seit 2012
Sprecher des DFG Forschungsgruppe GRK1743/1 “Genes, Environment and Inflammation”

seit 2012
Mitglied des Lenkungsausschusses “Inflammation at Interfaces”; Leiter des Forschungsgebietes I (Genetik)

2011
Peter Hans-Hofschneider Stiftungsprofessur

2011
Janssen Preis für Dermatologie

2009 – 2012
Sprecher der Jungforscher des Exzellenzclusters “Inflammation at Interfaces”

2008
100,000 € Hensel Preis für Ausgezeichnete Forschung an der CAU Kiel

Forschung

Publikationen

2019

Consistent alterations in faecal microbiomes of patients with primary sclerosing cholangitis independent of associated colitis

Rühlemann M, Liwinski T, Heinsen F-A, Bang C, Zenouzi R, Kummen M, Thingholm L, Tempel M, Lieb W, Karlsen T, Lohse A, Hov J, Denk G, Lammert F, Krawczyk M, Schramm C, Franke A (2019) Aliment Pharmacol Ther. 1-10. doi: 10.1111/apt.15375

FeaturedAlterations of the bile microbiome in primary sclerosing cholangitis

Liwinski T, Zenouzi R, John C, Ehlken H, Rühlemann MC, Bang C, Groth S, Lieb W, Kantowski M, Andersen N, Schachschal G, Karlsen TH, Hov JR, Rösch T, Lohse AW, Heeren J, Franke A, Schramm C (2019) Gut 0:1–8. doi:10.1136/gutjnl-2019-318416

2018

Exposure to the gut microbiota drives distinct methylome and transcriptome changes in intestinal epithelial cells during postnatal development

Pan WH, Sommer F, Falk-Paulsen M, Ulas T, Best P, Fazio A, Kachroo P, Luzius A, Jentzsch M, Rehman A, Müller F, Lengauer T, Walter J, Künzel S, Baines JF, Schreiber S, Franke A, Schultze JL, Bäckhed F, Rosenstiel P (2018) Genome Med. 10(1):27. doi: 10.1186/s13073-018-0534-5.

Exposure to the gut microbiota drives distinct methylome and transcriptome changes in intestinal epithelial cells during postnatal development.

Pan WH, Sommer F, Falk-Paulsen M, Ulas T, Best P, Fazio A, Kachroo P, Luzius A, Jentzsch M, Rehman A, Müller F, Lengauer T, Walter J, Künzel S, Baines JF, Schreiber S, Franke A, Schultze JL, Bäckhed F, Rosenstiel P (2018); Genome Med. 10(1):27. doi: 10.1186/s13073-018-0534-5

The sponge holobiont in a changing ocean: from microbes to ecosystems.

Pita L, Rix L, Slaby B M, Franke A, Hentschel U (2018); Microbiome, 6(46). doi: 10.1186/s40168-018-0428-1

Epidermal lipid composition, barrier integrity, and eczematous inflammation are associated with skin microbiome configuration

Baurecht H, Rühlemann M, Rodríguez E, Thielking F, Harder I, Erkens AS, Stölzl D, Ellinghaus E, Hotze M, Lieb W, Wang S, Heinsen FA, Franke A, Weidinger S (2018) J ALLERGY CLIN IMMUN . doi: 10.1016/j.jaci.2018.01.019

The antibiotic resistome and microbiota landscape of refugees from Syria, Iraq and Afghanistan in Germany.

Häsler R, Kautz C, Rehman A, Podschun R, Gassling V, Brzoska P, Sherlock J, Gräsner J T, Hoppenstedt G, Schubert S, Ferlinz A, Lieb W, Laudes M, Heinsen F A, Scholz J, Harmsen D, Franke A, Eisend S, Kunze T, Fickenscher H, Ott S, Rosenstiel P, Schreiber S (2018); Microbiome., 6(1):37. doi: 10.1186/s40168-018-0414-7

2017

Application of the distance-based F test in an mGWAS investigating β diversity of intestinal microbiota identifies variants in SLC9A8 (NHE8) and 3 other loci.

Rühlemann M C, Degenhardt F, Thingholm L B, Wang J, Skiecevičienė J, Rausch P, Hov J R, Lieb W, Karlsen T H, Laudes M, Baines J F, Heinsen F A, Franke A (2017); Gut Microbes., 8:55. doi: 10.1080/19490976.2017.1356979

2016

FeaturedGenome-wide association analysis identifies variation in vitamin D receptor and other host factors influencing the gut microbiota.

Wang J, Thingholm L B, Skiecevičienė J, Rausch P, Kummen M, Hov J R, Degenhardt F, Heinsen F A, Rühlemann M C, Szymczak S, Holm K, Esko T, Sun J, Pricop-Jeckstadt M, Al-Dury S, Bohov P, Bethune J, Sommer F, Ellinghaus D, Berge R K, Hübenthal M, Koch M, Schwarz K, Rimbach G, Hübbe P, Pan W H, Sheibani-Tezerji R, Häsler R, Rosenstiel P, D’Amato M, Cloppenborg-Schmidt K, Künzel S, Laudes M, Marschall H U, Lieb W, Nöthlings U, Karlsen T H, Baines J F, Franke A (2016); Nat Genet., 48(11):1396-1406. doi: 10.1038/ng.3695